Notre environnement est peuplé de micro-organismes.
Certains d'entre eux se développement lors du processus de compostage et jouent un rôle dans la dégradation de la matière organique.
Il s'agit principalement de bactéries mésophiles et thermophiles ainsi que de champignons.
En voici une brève présentation.
>> Bactéries
Les bactéries sont le type de micro-organismes le plus important du compost : 80 à 90% des milliards présents dans un gramme de compost. Elles utilisent une large variété d'enzymes pour casser chimiquement les matières organiques. Dans la première phase de compostage, les bactéries mésophiles prédominent. Lorsque la température du compost dépasse les 40°C, les bactéries thermophiles prennent le dessus. La diversité des bactéries est légèrement supérieure lorsque la température est comprise entre 50 et 55°C mais diminue rapidement après 60°C où seules les bactéries thermophiles subsistent.
>> Actinomycètes
Ces microorganismes ressemblent à des champignons mais sont en réalité des bactéries filamenteuses. Dans le compost, ils jouent un rôle important pour la dégradation des matières organiques complexes comme les cellulose, lignine, chitine et protéines. Certaines espèces apparaissent lors de la phase de compostage thermophile et d'autres durant la phase de refroidissement.
>> Champignons
Les champignons sont très importants dans le compost car ils décomposent des composés complexes et cassent les débris, ce qui permet aux bactéries de continuer le travail de décomposition. Les champignons sont nombreux dans les phases de compostage mésophile et thermophile.
>> Protozoaires
Les protozoaires sont des unicellulaires eucaryotes (ils ont un vrai noyau cellulaire contrairement aux bactéries qui ne possèdent pas de membrane nucléaire). Ils jouent un rôle mineur dans la décomposition des matières organiques.
>> Rotifères
Les rotifères sont des organismes microscopiques multi-cellulaires présents dans les lixiviats et l'eau contenue dans le compost.